KTHY, uçuşlarında evcil hayvan taşınmasına müsade etmektedir. Ancak filomuzda, evcil hayvan taşınması yasak olan uçaklarımızın bulunduğundan, yolcunun, uçuşuyla ilgili rezervasyon yaptırırken evcil hayvan taşıyacağına dair bilgi vermesi gerekmektedir. Check-in esnasında sadece kedi, köpek ve kuş gibi evcil hayvanlar kabul edilir. Yolcularımızın, geçerli aşı ve sağlık sertifikasına sahip özel kafes içerisinde kafes veya kutusuyla birlikte, ağırlığının 6 kg'ı aşmaması, kutunun 55 x 40 x 20 cm ebatlarından büyük olmaması ve su geçirmez olması şartıyla evcil hayvanlarını taşıyabilirler. Kabinde en fazla iki adet evcil hayvan taşınmasına Kaptanın itrazi olmadıkça izin verilir.
Bunların dışında kalan hayvanlar uçağın kargo bölümünde taşınır.Kafesin üzerinde, yolcunun ve hayvanın ismini belirten bir etiket olmalıdır.
Uçuşlarımızın tümünde kemrigen hayvan türleri tehlike araz ettiğinden ötürü (Fare,sincap..vb...) kesinlikle taşınmaz.